自晚第三纪以来，境内普遍接受了上第三系和第四系的沉积（主要为*河泛滥冲击物和洪积物），除东阿沿*河一带不足50米高的10余座孤山有古生界奥陶系灰岩出露外，其余均为新生界第四系所覆盖。第四系厚度一般为0—米，以临清、莘县、高唐一带厚度较大。第四系包括全新统和更新统。全新统主要为冲积物和洪积物，沉积厚度7—25米，广泛分布于全市；更新统主要为河湖相沉积，厚度0—米。第四系以下主要有：上第三系明化镇组、馆陶组；下第三系东营组、沙河街组、孔店组；古生界石炭二迭系、奥陶系、寒武系，还有古生界变质岩等。
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